スカートの破綻を防ぐ方法については、動きの初めと終わり、あとその間の適当なところのフレームいくつかで、
スカートの全てのボーンを選択して登録しとくといいよ。

あとはモデルのスカートを破綻しにくいものにする方法もいくつかある。
↓は古典的な方法で、少しマシンパワーは要るが、現代的なマシンなら特に問題はないだろう。
【MMD】2658jointふわっふわスカート実演ぱんつ講座 - ニコニコ動画
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