水匠2の定跡使用で先後入れ替えの連続対局したい場合は、
sentebookとgotebookはどのように使用すれば良いのでしょうか？

先後入れ替えにせず、予定の半分を先手連続でやり、残りを後手連続でやるということでしょうか？

また定跡ありで、検討や棋譜解析したい場合は一方のみか、2つ走らせるしかないということでしょうか？