> Apple Watchは見ていた ～ 故障で走れなかった半年間に心肺機能が大きく低下していた

そりゃそうでしょ。
昔は純粋なランニングだけをカウントしてたのに、
ただの散歩をスロージョグと言い張って、
それをジョギングにカウントしてほとんど走ってなかったんだから、
心肺機能は低下するに決まってるよね。