以前「ＯＳ：ＸＰproでWord98でAtok6使ってると、Word98が飛んでしまいます。」と書いた者です。
ようやく、事故解決しました。

justsystemのサポートページＱ＆Ａで掲載されている
「Windows MeもしくはWindows XP環境でATOKを既定の言語
として設定している場合、Word2000終了時にエラーメッセージ
が表示される」
http://faq.justsystem.co.jp/faq/1003/app/jsfaq.jsp?16554+0161
と同じ処置で解決しました。

解決策「Wordの[自動スペル チェック]、[自動文章校正]をＯＦＦにする」です。

Ｑ＆Ａで照会されてるのはＸＰでWord98という組み合わせだけど、

ＸＰ上でWord98,Word2000、Ａｔｏｋ１５、Ａｔｏｋ１６共通の問題と思われます。

潜在的な被害者は、結構いる様に思われます。