>>490
Shrinkの再編集モードで必要なチャプターだけ切り出して、同じ作業すれば良いじゃん。

というか逆に、切り貼りしていないんだったらVobMergeいらんだろ。
Shrinkの再編集モードで本編だけにして、出力ファイルのオプションで
「VOBファイルを1GB単位で分割する」をチェックオフすれば１つのVOBで出力される。