どちらかというとUnityの話になると思うんだが。
Blender独自のファイルかfbxなのかは知らんが、確かblenderファイルだと
内部処理でBlender FBX エクスポーターで読み込んでたはず。
マテリアルはそもそも互換性がないし（色ぐらいは引き継がれた気もするけど）
テクスチャも参照があわなかったりするね。
基本的にはシェーダーもBlenderとUnityじゃ構造が違うし、テクスチャもアセットフォルダに
入れて適用するのが基本だから、Blenderで素材作り、UV展開＆調整
Unityでシェーダー調整、テクスチャ適応、ノーマルマップ....etcって流れが標準だと思われ
