俺の話が理解できないなら自分で試して見ろよな

バックアップと同期アプリのオプションで
・アイテムは削除しないに設定
・GooglePhotosのアップロードにチェック

スクリーンショットを撮ってデスクトップに保存
→Photosにスクリーンショットがアップロードされたことを確認
ローカルデスクトップからスクリーンショットを削除
→DriveとPhotosにはスクリーンショットが残っていることを確認
クラウドのデスクトップフォルダからスクリーンショットを削除
→Photosからもスクリーンショットが削除される

このPhotosからもスクリーンショットが削除されるのが不便って話をしてんのに
>なぜ、クラウドのデスクトップ内に保存されたスクリーンショットを削除する？
とか馬鹿なこと言ってくんなよチンパン