上位者となる条件は「瞳の獲得」だけで完結してると思うけどね
瞳＝高次元を観測する器官であり、高次元を観測さえできるのならば出来損ないの脳みそだろうと白痴だろうと上位者と定義される

だから作中の人間で瞳を得たと呼べる者は居ない
へその緒を3本使った主人公が即座に上位者とならないのは月の魔物による時間操作（＝獣狩りの夜）に囚われたことにより進化が停滞しているため
月の魔物を倒さなければならないのは夜から解放されるため結果として必要になるだけで月の魔物を倒すこと自体は進化とは関係ないと思う

夜明けエンドでへその緒を使った主人公が上位者となれないのは介錯により悪夢（＝高次元領域）との繋がりを断たれる際に
高次元との接続装置であるへその緒の影響も同時に断たれてしまうとかそんな感じだと思う