お米ちゃんが黒幕じゃね？

根拠1
全てのエンディングでお米は死なず、龍いんの無力化を達成(修羅除く)

根拠2
米ババアがまんまと寺を抜け出す上に、あらゆる危険地帯に平然と出没
明らかに協力者がいる
明らかに柿入手を扇動している

根拠3
扉一枚隔てた奥の院に安息を保障される

根拠4
なんとか上人のへりくだった態度
明らかにお米の手玉に取られている