大きく変わったのはみっつ、小さいけど変わったのはひとつ
仲魔が育成できること、バトル形式が真女神転生3からガラッと変わったこと、仲魔を登録して金で呼び出せるようになったこと
あとダンジョンがfpsからtpsに変わった
それ以上の大きな変化はない