ここは「jQueryの使い方」の質問スレ
「jQueryで作られたもの」は知ったこっちゃない
分からないならサポートに聞くと良い

個人的には色々いじるんじゃなく、
・カラーボックスを使わない
・カラーボックスの部分はちゃんと勉強する
で、すぐに解決すると思う