「そして、いつの間にか、反日意識に凝り固まった人たちが多く所属している」

仰る通りだと思います。原理教育においても反日教育になっているような気がします。
私が調べた限りにおいては、６０４ページもある原理講論には、反日？と思えるように箇所はわずかに２行だけです。
それなのに、原理講論に書かれていない反日の内容を統一教会内において教育するのは間違っていると私は思います。

「なぜ、反日団体になってしまったのだろうか」

私の推測では統一教会自体が共産化しているのが原因だと考えています。
何故なら、反日教育を推進しているのは、左翼主義者や共産主義者だからです・・・

http://blogs.yahoo.co.jp/chubu_seiwabu/7551500.html