本来の流れは

メインクエと同盟クエを同時進行で進める
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メインクエが一定に達すると進行が停止して同盟クエを終わらせるよう促される
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出身の同盟クエを終わらせるとモラグバルへ対処するため人間勢力の軍事力を集結して攻め込もうぜってなって
戦士ギルドと魔術師ギルドと三同盟の長が一堂に会してコールドハーバー突撃偏が始まる
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このクエストラインを終わらせるとモラグバルのニルン侵略が止まって
モラグバルを倒し自分の魂を取り戻すためのメインクエ最終章が解放される

って流れだった