敦賀→小浜間の野坂山地、絶滅危惧種の密集した生息地に観光アセスが完了せず難航。工期が遅れる。
小浜→京都間の丹波高地、地質調査とは全く異なる地層に出会い工事難航
同じく、丹波高地、絶滅危惧種の密集した生息地により、ルート変更を余儀なくされる。
京都市内、トンネル工事中に高森線のトンネル建設中に出水した以上の
地下水が溢れてきて工事中断。

京都→新大阪、用地買収に手間取り工期延期が続く。

以上の事で工費が予算の5倍以上になり、この区間の工事を断念ｗ