値段が高いのは
・借金が多い(金利も多い)
これがいちばんの理由

・建設時に返済不要の公的補助の割合を増やす
・低利や無利子で金を借りる
・金利が高い借金は低金利の借金に借り換え

つくばエクスプレスみたいに、第三セクターに巨額の借金を背負わせない方式なら
値段はもっと下げれる