ラッシュ時に使ったことないからあくまでもイメージなんだけど、
鶴見線と南武支線や房総ローカルって、4ドアじゃないと絶対ダメなのかな。

運転本数もそこまで多くないし、ラッシュ時でも停車時間伸ばせば問題なさそうな気がするんだけど。（大阪の環状線だって4ドア→3ドア化出来たんだし）

E129の3ドアで必要十分では。
もちろん座席は線区ごとにオールロングやセミクロス選べば良い。