ギャロス包囲戦の手紙の中に、
「崇高なるカルキスト・イオンへ、この書状を貴方がキティラ島で見つけたとなれば」
「彼ら（メカニト）の船がキティラ島からやって来たと」

というくだりがあるので、多分ギャロス包囲戦と同時進行でイオンの軍勢がメカニトの拠点であるキティラを侵攻する計画だったんだと思う。
そしてギャロスは陥落したがイオン（とオロク）はキティラを陥落させたのではないか。
それがSCP-3989なのではないかなぁ