3133は大体理解できたと思うけど博士の心理がよくわからん。

A:何もせず5人を見殺しにする
B:自分でポイントを切り替えて1人を死なせる

3133に曝露するとAが正しいと思うようになるから広がるとBの立場である財団が崩壊する
けど博士は曝露しながらBの行動を取ってるし
多分契約とか倫理委員会のくだりが答えなんだろうけど