財団がメインだと商業的な話はイマイチ話作りにくいってのはあると思う

異能持ちの主人公→収容　
いけっ！ピカチュウ！→SCPでクロステストすんなks
巻き込まれ系主人公→記憶処理

SCPを破壊できるならなんでもOKなGOCとか、異能者同士したレジスタンス的な要素が強い蛇の手とかの方が商業向き