そもそも自我が芽生えてるのではなく、内蔵バッテリーに入れてある旧人類に上書きをされ始めているのでは？
ヒューマギア自体が人類保護のための殻に過ぎない感じ
滅亡迅雷net二人だけは自我に芽生えてヒューマギアの本質を守ろうとしてるんじゃないか？