この2つをバックアップから復元
C:\Windows\System32\Macromed\Flash\Flash.ocx
C:\Windows\SysWOW64\Macromed\Flash\Flash.ocx

PowerShellで↓を実行
regsvr32 C:\Windows\System32\Macromed\Flash\Flash.ocx
regsvr32 C:\Windows\SysWOW64\Macromed\Flash\Flash.ocx

これでMPC-BEとIEでFlashが使えるようになってた
レジストリの操作は不要