matplotlibはデフォルトで２つのデータ点を直線で結びますが、
一部分だけ線を引かないようにすることは出来ますか。

gnuplotなら、渡すデータを
1 1
2 2

3 3
4 4
のように空行を挟んどけば、(2,2)と(3,3)はwith lineの対象外になるのですが