CSV:一般的でシンプルで扱いやすい。
INIファイル:以前の標準、いまでも使えるがCOMオブジェクトロードする必要がある。フォーマットは直観的で使いやすい。
Json:上記に比べると、オブジェクトをそのまま保存可能というメリットがある。フォーマットは上記よりわかり難いが特に問題はない。
XML:汎用性があるが、直観的なフォーマットではないのでわかり難い。普通はこんなものをたいそうに使う必要はない。

などがあって、基本はCSVが標準だろうと思う。しかしクラスをそのまま保存するような場合はjsonがおすすめだ。例えば
カラーコードやフォントを保存する場合にはCSVだと、いちいちテキストなどに変換する必要があるが、jsonのシリアライズを
使えば何にも考えずに保存できる。MSもJnonのIFを用意しているが、Json.netの方が優れているのでそちらの方を使った方がいい。