>>979
ちょっと覗いてみたけど

NetHttpTransport.buildRequest
　　・ConnectionFactoryでconnectionを作成
　　・NetHttpRequestを作成
　　　　# setTimeoutがあるけど呼び方がわからぬ

って感じだった
HttpRequestInitializerを呼び出すのはHttpTransportだと思うんだけど
どこで呼び出してるのかよくわからんかった

ConnectionFactoryを指定してみたりとか

final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport.Builder()
　　　　.trustCertificates(GoogleUtils.getCertificateTrustStore())
　　　　.setConnectionFactory(new DefaultConnectionFactory() {
　　　　　　@Override
　　　　　　public HttpURLConnection openConnection(URL url) throws IOException {
　　　　　　　　HttpURLConnection con = super.openConnection(url);
　　　　　　　　con.setReadTimeout(1000000);
　　　　　　　　con.setConnectTimeout(1000000);
　　　　　　　　return con;
　　　　　　}
　　　　})
　　　　.build();

JVMの設定を入れてみたりとか
System.setProperty("sun.net.client.defaultConnectTimeout", "100000");
System.setProperty("sun.net.client.defaultReadTimeout", "100000");

Javaの起動時にJVMのオプション指定したりとか試してみてはどうだろ