まぁ上司はプログラムを組むためにいるんじゃなくて旗降って仕事の進め方を決めてみんなを引っ張って行く立場だからある程度仕方ない。

今後取って行く方法はいくつかあるように思えるけど、パッと思いつく方法をいくつか。

・余計なことはせずに上司の言われたままの作業を行う。ある意味、頭使わないから楽。ツールは徹頭徹尾自分の作業の効率化のためのみに作成する。

・ツールはシートやオブジェクトで触って良いところを除きガッチガチにロックして、入力チェックもガッチガチに行う。もちろんVBEもパスワードを掛けて自分以外は触れないようにする。代わりに操作マニュアルはキチンと作る。
いくら上司が出来ない人と言っても使う方法が分からなければ聞いてくるだろうし、使い辛ければ指摘もしてくる筈。それに対応すればVBAで作ったツールも認められるようになると思われる。

・他の人が便利に使っている実績を更に上の上司にアピールし、この上司が使えない人だというレッテルをそこはかとなく周りの人達にはらせてしまう。
明らかに上に立つのに知識が不足していて会社の発展に妨げになると感じた場合、かつ、業務的な知識が自分の方が遥か上を行ってると見てとれた場合、その上司はあなたにとって不必要どころか害悪にしかならない。よって、常にイニシアチブを自分が握り、その上司には何もさせない方向に持って行き、最終的には部署から消えて頂く方向に持っていく。
ただしこの方法は業務、プログラムの知識が自分の方が遥かに上と見てとれる場合で、かつ自分の立場が危うくならない場合に限られる。