新幹線が東京近郊区に入っていないのは事実ですがこの区間は新幹線は在来線
と同一線なので別線に乗った、すなわち東京近郊区の外に出た訳ではない、と
判断しています。でもJRは同じ回答メールでこうも言っているので、

(回答概要) 乗車経路が決まっている場合には乗車経路どおりお求めください

規則スレ住民の中には「新幹線乗車で選択乗車の権利を捨てたんだあぁ!!」
と手を叩いて「自分の正当性はJR回答によりお墨付きを得た!」な解釈をする
人も出そう。

ところで夏の休みはもう他の事で使ってしまい、また多忙で休みづらくなって
大回りの実験をする日程が当分、取れそうにありません。実験レポートについて
は、あまり期待せずにお待ちください。