東海道新幹線改札は乗券と特券の組合わせが入場時と同じでないと区間一緒でも弾かれる？

例えば同じ乗車券でも入場時は名古屋→東京の自由席と二枚重ねなのに、出場時は名古屋→東京の指定席券みたいなケース