確かに「就労」が大きなキーとなると思います。
自分の経験から言えば、休職中は一部給与が支給されていましたが二級になりました。
但し現状確認の診断書には「休職中・就労不可」と記載があったので、ケースにもよるかと思います。

審査基準の公平を期すためガイドラインが導入されましたが、各都道府県によって同等の診断書が、
違う結果になっていることも現状らしいです（依頼した社労士説）