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レガシーブート MBRディスク
アクティブパーティション設定になっているシステムで予約済みになっているパーティションのルートにある
bootmgr.exeがBootフォルダ内にあるBCD設定からシステムパーティションを判別して起動します
このロジックをよく分かっていない人がネット上にはたくさんいます
システムのインストールしてあるパーティションがアクティブになっていればいいと勘違いしている人達です

UEFIブート GPTディスク
EFIシステムパーティション(FAT32)の\EFI\Microsoft\Boot\bootmgfw.efiが\EFI\Microsoft\Bootフォルダ内にある
BCD設定からシステムパーティションを判別して起動します

bcdedit /enum allでも表示して見てみましょう