ティラノビルダーは対応するらしい
ただ出たばかりのツールなので色々と不便

http://tyranoscript.blogspot.jp/2014/04/ver-012.html

主な追加機能は、クリッカブルマップへの対応と
グラフィカルに画像サイズや位置を指定できるツールを追加しました。

背景画像をクリックした時にイベントを発生させるゲーム（脱出ゲームみたいなやつ）を作成する場合
クリッカブルマップを使用します。

その際、座標の指定などが面倒なのですが、今回追加された機能を使うとキャプチャ画像のように、背景を確認しながら位置を決定することができるようになりました。