【情報共有】Unityのバージョンによるマップエディタ(TilePalette)について
2017.3.1f1：表示される
2017.4.1f1：表示される
2017.4.2f2：表示されない
2018.1.0f2：表示されない
2018.2.0b3：表示される（メニュー位置が Window > 2D > Tile Paletteに変更されています）

以上より、現状 Tile Palette を最近のバージョンの Unity でお使いいただくには、2017.3.x,、2017.4.1、また、ベータ版となりますが、2018.2.xのいずれかをご利用していただく必要がございます。

上記スプライトが表示されないバージョンで開いたプロジェクトを例えば2017.4.2で作成し2DGameKitを展開してスプライトが表示されないことを確認したあと、同じプロジェクトを2017.4.1や2018.2.0b3で開くと再度スプライトが表示されるようになりました
あるプロジェクトで Tile Palette のスプライトが表示されなくなっても、それで Tile Palette のアセットが壊れてしまうということではないようです。