それって
エラーで検索出てきたページの
http://ha1f-blog.blogspot.com/2014/11/unity-dllnotfoundexception.html?m=1
ここに、書いてあるのじゃないですかね？
-引用-
調べてみると、UnityはPluginsの直下にdllが１つでもあると探索をやめてしまうようです。
すなわち、あるプラグインが直下にあって、その他のプラグインがたとえばx86_64の中などにあると、そのフォルダの中にあるdllが読み込まれなくなります。

ここの対応をしたんでしたっけ？