なるほど把握した。
こちらはwin10
動作としては
Layer 1 と2があるとして、
Layer1 の名前をクリックしてctrl C、そのままctrl Vで新たにLayer1の複製が作られる。

Layer1のサムネをクリックしてctrl C 、レイヤー2の名前をクリックしてctrl V でレイヤー2の内容がレイヤー1にコピーされ全て上書きされる。

ちなみにバージョンは1.2.16.3

変な動きするならバグかも知れない。