流れを説明すると
プロジェクトを新規作成する
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任意の場所にプロジェクトフォルダーができる
↓
パッケージをインポートする
↓
プロジェクトフォルダーの直下のアセットフォルダーにパッケージフォルダーがコピペされる
↓
このコピペ自体はOSの機能だからプロジェクトを保存しなくても戻らない

こんな感じ
プロジェクトウィンドウはプロジェクトフォルダー直下を見てるだけ
だからOSのエクスプローラー機能からそのフォルダーになんか入れればそれがUnityでも簡単に反映される