プラグイン内部で「変数やスイッチの番号を変数で指定」してるのはさすがに対応してないんじゃなかろーか。
単純に$gameVariables.value(1)とか$gameVariables.setValue(1,x)とか基本文法の置換は仕組みが単純だし対応してるとは思うが