作りたいゲームでGUIウィジェットを活用するのでなければ素直に1画面ゲームを作るの良いと思うな
画面複数になったら画面間の連携も考える必要が増える

ゼロ知識状態で
>ツクールにあってGodotにはない機能を実装してけば
は難しすぎるのでないだろうか?

まずは簡単な1画面ゲームじゃないかな
公式のチュートリアルでどうだろうか?
docs.godotengine.org/ja/4.x/getting_started/first_2d_game/index.html