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佐々淳行（警察庁キャリア）は初代内閣安全保障室の室長で、内閣情報調査室とは別組織。
内閣安全保障室の所掌事務は安全保障・危機管理で、内調の所掌事務である情報収集・分析とは異なる。

また、内閣官房の職員は、各省庁の出向で構成されているが、内調と衛星情報センターは例外的にプロパー（内調採用職員）がいる。
あと、内調への出向には警察庁、防衛省、外務省の他に公安調査庁からの職員もいる。