商船構造はSolas条約で決まった強度とか復元力などの要件を満たす必要がある。
軍艦構造はその要件を満たす必要が無いと言うだけ。

軍艦構造=強い　商船構造＝弱い　ということは全然無い。

一般的に商船構造は安全重視で、軍艦構造は性能重視。
だから魚雷を何発もぶち込まれて沈没しない商船構造のタンカーというのがある。