>ドック入りでの進捗状況の把握なんて、それこそ屋根かければ同じ事だし。

地上はスパイが偵察し放題だろ。
海底基地はスパイが入ったとしても連絡手段が超限定されるから
その点では有利だと思うね。まぁコストは膨大だろうが。