つくば市は東京が水没するような場合は、霞ケ浦周辺も水没するのでアウトだが
限定的な核攻撃の場合に、政府機能を移すために作られた
全ての省庁の関連機関があり迅速な対応が可能であり
周囲には陸自の駐屯地（霞ケ浦駐屯地、土浦兵器学校）や
空自基地（百里基地）があるため防衛面でも有利

シンゴジラで出てくる立川のは防災施設であり
せいぜい地震やゴジラへの対応どまりだろう