心構えとかの問題にされがちだけど

敵艦隊の撃滅が優先か、攻略が優先かというのは攻撃隊の編制と空襲のスケジュールに違いが出る
テクニカルな話

「基地航空隊との交戦中に敵空母が横槍を入れてきた際にこれを撃沈しなきゃならんのか、封殺すれば良いのか」の違い

それと上陸部隊の安全をどこまで顧みるか
敵空母撃沈の公算を高めるため半数待機に雷撃機を増やせばその分、飛行場の破壊は不徹底となり上陸部隊の危険は増える

ともあれ、敵の基地航空隊を撃滅した後ならば、空襲部隊の仕事は敵空母を待ち伏せて撃沈する以外ないんだから
差が出るのはまさに、空襲当日に、敵空母から横槍を入れられた場合