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例えば、駅やデパートなどに軍人が居たとしても、そこへ戦略爆撃や今ロシアがやってるようなミサイル攻撃をすれば、それは民間人に対する戦争犯罪です。
イスラエルではテロの増加に伴い、たとえオフであっても徴兵に対してアサルトライフルを持って出かけるようにさせていますが、これに攻撃してもテロになるでしょう。
イギリスのSASはテロ対策によく動員されますが、その結果としてテロリストの報復対象となり、正体を隠すようになりましたが、それだって暗殺・テロ扱いです。

国民皆兵だろうが、或いは休暇中の正規軍軍人だろうが、戦闘活動に従事しておらず、民間設備を利用している所を攻撃すれば、それは戦争犯罪です。
詭弁を用いた所で、免罪符にはなりません。