帝国海軍艦隊編成の建制とか軍隊区分とかの基礎知識がまるごと欠如してるんじゃないかと本気で心配になってきた
幼女大好き変態君がここでどれだけ恥を晒そうと知ったことではないのだが、どこまでレベルを下げて解説すればいいのか底なしの徒労感

第三艦隊(フィリピン攻略)
1941年4月10日 新規編成
1942年3月10日 第二南遣艦隊へ改称、終戦まで存続

第一航空艦隊
1941年4月10日 新規編成
1942年7月10日 解隊(南雲長官・草鹿参謀長 翔鶴・瑞鶴・隼鷹・龍驤) 
第三艦隊(建制機動部隊)
1942年7月10日 新規編成(南雲長官・草鹿参謀長 翔鶴・瑞鶴・隼鷹・龍驤+瑞鳳・飛鷹)
1944年11月15日 解隊

つまり
41.4.10----第三艦隊----42.3.10改称-----第二南遣艦隊--------------終戦
41.4.10----一航艦--------------42.7.10----第三艦隊----44.11.15解隊

上記の通り、フィリピンの第三艦隊と一航艦は同じ日に編成されたが、第三艦隊は第二南遣艦隊に名前が変わって終戦まで存続
一航艦は42年7月10日という同じ日に、司令長官・参謀長という指揮官と配下の空母を引き継いで(第一艦隊からの瑞鳳、完成した飛鷹を加えて)新編
つまり機動部隊である第三艦隊は名実ともに一航艦のアップデート後継版

要するにフィリピンの第三艦隊と機動部隊第三艦隊は、まったく別系統の別艦隊
なんでこんなキホンをタダでものすごく分かりやすく解説してやらなきゃいかんのか