台風や地震だって発生原理が判明したのは相当近代になってからのこと
阻止不可能な大怪獣は、たまたま進路上に街があれば破壊をもたらす程度の自然災害（または荒神様）と認識され、それに適応した人類の文明は普通にできるだろう