chinachuやepgstationで録画した番組をffmpegでエンコードすると解説音声だけになってしまうのだけれど、解決できた人いる？

詳しく書くと、前の番組がシングルモノで録画番組がステレオだと起きる
nhk総合の朝ドラとかが該当する
ニュース(シングルモノ) → 朝ドラ(ステレオ)

ffmpegの analyzeduration, probesize を設定したけど効果は無い模様

linuxでやる方法は知らないけど、頭出ししないと解決できないかな？