第二子も早々にNIPTを受けたのでそもそも全染色体は始まっていませんでした。

ご参考までに羊水検査を受けない理由は以下です。
まず下は先天性疾患(発症率3-5%)の全体を100%とした場合の原因内訳です。
・染色体異常25%(羊水検査で分かる部分)
・単一遺伝子20%
・多因子遺伝50%
・その他5%
第一子の奇形原因は多因子遺伝(複数の原因が重なる、要は原因不明とのこと)でした。そもそも羊水検査でもわからない部分です。
最低限の検査、と言ったのは先天性疾患の中でも現段階で受けられる検査は上記の25%部分のみで、残りはエコー等で診るしかないようです。

スレ違いとならないように当時のノート引っ張って情報持ってきました...。荒らしてすみません！