DFで差分みながらなんてそんな前世紀的な……

とりあえず subversion、あるいは TortoiseSVN でぐぐるんだ。
サーバたてなくても、ローカル、あるいは、適当なネットワークフォルダでも
運用できるから、早急な導入をおすすめする。