>>666 バージョンアップとパッチの使い分け
どちらでも構いません
世界1つの追加だけど全部まとめて、というのもOKですし、
バージョンの上がる更新をパッチで行う、というのもOKです
(ぶっちゃけルールが無い)

パッチはアップロードもダウンロードも早いので慣れれば手軽ですが、
ファイルの削除が行えるのは全部まとめてアップロードする場合に限られてしまうので
その辺を考慮して使い分けるのがベターかも