商業作品だと2Dアニメや3Dモデルで作ったモーションをレンダリングしたものを減色させて
最後にドッターがドット絵の技法で整えるって方法をとる場合とかもある
格ゲーのドット絵なんかはその方法が多いんじゃないかな？

MVやMZの48なんて慣れりゃ裸の状態からでも1キャラ2時間もあれば余裕で完成させられるし
なんでもものは試しでチャレンジしてみればいいよ