機雷には遠距離からの信号受信機能があるから、ソフトキルできる可能性は０ではない
時空泡突入までが時空泡の質量や指定によって選定してるとしたら
突入後は何らかのセンサーで艦艇を認識して自動追尾だろうし、それを狂わせることができる物質があればチャフにはなるかな

中に人が入ってない以上、認識、識別、行動のどっかに介入できれば無人兵器は無効化できる
・・・が、そんなもんはよほど徹底的にシールドされてるとは思うけどね